Itaru Nakamura, jefe de la agencia de policía nacional, dijo que quería asumir la responsabilidad por el tiroteo del 8 de julio.
Una investigación descubrió que hubo fallas graves en la forma en que se protegió al ex primer ministro.
A Abe le dispararon mientras hablaba en un evento de campaña política en la ciudad de Nara. El hombre armado de 41 años pudo caminar detrás de Abe y dispararle con un arma casera mientras estaba dando un discurso.
«En el proceso de verificación de nuestro nuevo plan de seguridad, nos dimos cuenta de que nuestras funciones de seguridad necesitarían un nuevo comienzo», dijo Nakamura en una conferencia de prensa cuando anunció su renuncia.
Los expertos en seguridad que revisaron las imágenes del ataque le dijeron previamente a la agencia de noticias Reuters que los guardaespaldas podrían haber salvado a Abe protegiéndolo o sacándolo de la línea de fuego en los 2,5 segundos entre un primer disparo fallido y la segunda ronda fatal de disparos.